COVID-19——加速您的PCR构建

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COVID-19——加速您的PCR构建

由于冠状病毒疫情的爆发,SNP意识到自己正在分析极端数量的样品,自动化平台的产能已经达到极限。同时,工作人员必须花费更多的时间来构建新的病毒检测流程,这些流程通常需要依靠手动操作或者使用半自动化的方法以优化检测响应时间,使操作者面临更重的人体工程学负担。显然,他们需要更多的自动化液体处理设备来提高样品处理能力,以减少实验室分析人员的人工干预,并加快COVID-19样品检测的试验构建。

ASSIST PLUS pipetting robot
Photo courtesy of Sullivan Nicolaides Pathology

携手合作

2020年3月初,INTEGRA澳大利亚经销商BioTools Pty Ltd的Kelly Magin和James Sundholm与微生物学和分子病理学部的科学部负责人Shane Byrne合作,旨在使用ASSIST PLUS移液工作站支持患者样品的COVID-19检测。一套基于ASSIST PLUS的自动化移液流程被开发出来并加以验证,使样品能够以较小的体积在384孔板中进行制备,可使用同样基于孔板的快速、高通量实时PCR扩增和检测仪器进行后续处理。

VOYAGER可调枪头间距移液器低残留GripTips™移液枪头可用于将一步法RT PCR预混液(Mastermix)从低残留(<20 µl)的SureFlo™10 ml试剂储液槽转移到384孔板中。VOYAGER移液器还支持自动转移和重排布,可将提取自鼻咽/口咽植绒拭子或痰混合样品的核酸模板从4个FluidX™1.0 ml 96规格试管架中转移至384孔板中。PCR总反应体积降低到了10 µl,即 7.5 µl一步法RT PCR 预混液和2.5 µl核酸模板。这种体系的缩小使现有的检测能力翻了一倍,同时降低了昂贵且来源紧张的一步法RT PCR试剂的消耗,节省了相关的成本。

Close-up of the ASSIST PLUS pipetting robot testing patient samples for the coronavirus
Photo courtesy of Sullivan Nicolaides Pathology

决定性成功

SNP参照其现有的手动处理方法(使用手持式电动移液器)成功验证了这套自动化流程。其结果准确、精密且可重复,在对照组或患者样品中均未观察到污染。 紧凑、易用的ASSIST PLUS移液工作站连同经过验证的流程已在五个工作日内部署完成。虽然目前流程使用的是384孔板,但可以很容易地调整至96孔板规格,以满足未来的需求。

Two scientists standing in front of the ASSIST PLUS pipetting robot used to test patient samples for COVID-19
Photo courtesy of Sullivan Nicolaides Pathology

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