自动化助力简化虫媒病毒检测的样品混合

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自动化助力简化虫媒病毒检测的样品混合

虫媒病毒,专指所有通过节肢动物携带者(如蚊子和扁虱)传播的病毒,其中就包括西尼罗病毒和东部马脑炎病毒,两者均能经由感染蚊子的叮咬感染人类。一些监测项目能够为如何应对这些蚊媒传染病提供有价值的数据,新罕布什尔州公共卫生实验室的虫媒病毒检测实验室所运营的项目就是其中之一。

与世界各地的很多实验室一样,COVID-19 疫情迫使虫媒病毒检测实验室对其蚊子监测项目进行了巨大的改变,采用了借助 ASSIST PLUS 移液工作站的自动化混合样本检测工作流程。实验室主管Denise Bolton解释说:“我们意识到,对于检测物资的需求激增、有限的PCR仪器产能以及实验室工作人员的巨大压力还将持续一段时间。早在疫情之前,我们就一直在考虑尝试一种用于虫媒病毒监测的混合检测模型,而现在,我们认为是时候该实施这种方法了。”

ASSIST PLUS pipetting robot with three deck positions with a 96 deep well plate, INTEGRA rack for swab tubes, GripTips and the VOYAGER adjustable tip-spacing pipette

转向混合检测

在研究了混合检测方法并为实验室设计了方案后,他们通过检测不同浓度的WNV/EEE阳性样本组合进行了“概念验证”。实验证明,在由4份试样组成的混合样本中,即使是非常低浓度的阳性样本也能被检出。“验证实验显示了很高的准确度和灵敏度,我们在2020年夏天应用了混合样品检测流程,最初采用手动进行样品混合。蚊子的处理是一项非常繁重的工作,很多步骤都需要打开和盖上试管以及移取样品,并且所有步骤都必须严格遵循安全流程来执行。额外的样品混合步骤让整个步骤更加繁琐了,需要占用实验员超过一小时,且需要高度的集中和专注。从质控的角度来看,在处理过程之后增加一个手动的混合步骤也是很有风险的,我担心实验员可能会出错。”

Aautomated pooled sample testing workflow using an ASSIST PLUS pipetting robot
Photo courtesy of Denise Bolton, Laboratory Supervisor

降低出错概率

为了尽可能地降低出现手动处理错误的可能性,该实验室决定在一台ASSIST PLUS移液工作站上将样品混合过程自动化。“我很熟悉ASSIST PLUS,因为我们用它来处理我们的COVID-19样品,”Denise说。“随仪器提供的VIALAB软件让编写混合程序变得非常轻松,而INTEGRA移液器的灵活性意味着我们无需改变我们的蚊子处理方法。我们使用ASSIST PLUS配合一台8通道的VOYAGER可调枪头间距移液器来将试样从2 ml试管中转移到96孔板中,以构建包含4份样本的200 µl混合样本。该过程完成后,ASSIST PLUS会直接将裂解缓冲液加入混合样本,随后整个混合样本将被用于核酸提取。这简化了处理过程,节省了时间并且减少了塑料实验室器具的使用,因为我们不再构建大体积的混合样本然后移取等分来进行提取了。如此应用ASSIST PLUS让我们得以将2个此前需要手动执行的步骤自动化,实现了2个移液步骤的自动化,实际上减少了对用户输入的需求。”

8 channel VOYAGER adjustable tip spacing pipette

节省时间和经费

对虫媒病毒监测采用了混合检测后,提取和PCR试剂节省了75%,监测项目对PCR仪器的使用也减少了。“使用ASSIST PLUS移液工作站进行样本混合节省了实验员的宝贵时间,更重要的是,它让我们确信整个过程中最复杂的步骤正在无误地执行,”Denise 总结道。

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