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我们的液体处理解决方案如何简化NGS工作流程
步骤1：样品制备：试样等分和核酸提取
试样等分/重排布
诸如血液、组织等各种类型的样品会被收集到原始试管中。试样等分或重排布通常需要逐个吸取部分样品，并将其转移到相应规格的器皿中以进行核酸提取或长时间保存。
我们的解决方案：我们推荐使用ASSIST PLUS移液工作站搭载VOYAGER可调枪头间距移液器来实现该步骤的自动化。ASSIST PLUS能够自动执行日常移液任务，从而加快您实验室的科学研究。这款多功能平台可搭载任意型号的VOYAGER和VIAFLO多通道电动移液器以及D-ONE单通道移液模块，以完成各种复杂的自动化操作。
浏览我们的应用纪要和附带的现成程序，详细了解如何使用ASSIST PLUS来完成从试管到孔板的样品重排布。
如果您更倾向于手动工作流程，也可以脱离ASSIST PLUS，单独使用VOYAGER。它的一键调节枪头间距功能可以帮助您在不同规格的实验室器具之间同步转移多个样品，提高操作效率。
核酸提取
核酸的提取方法多种多样，磁珠法也是其中之一。提取之后，首先要检查所取得的DNA和/或RNA是否满足文库构建的要求。质量评估可能包含基于荧光的浓度测定、检验完整性的凝胶电泳以及检测纯度的光密度测定（A260/A280和A260/A230的比值）。
我们的解决方案：如果您使用磁珠法来提取核酸，那么我们推荐您使用MAG或HEATMAG模块与ASSIST PLUS移液工作站或者VIAFLO 96和VIAFLO 384手持式电动移液器的组合。如此既可实现磁珠工作流程的半自动或全自动化，消除手动错误并优化效率和可重复性。MAG和HEATMAG模块配备了强力磁体，且可自动上升和下降，能够快速、精确地收集磁珠。除此之外，HEATMAG还内置了最高65°C的控温加热功能，可提高裂解和洗脱效率，尽可能地提升产量。
步骤2：文库构建：制备待测核酸
在文库构建过程中，此前提取的DNA或RNA片段将被转变为适合测序的规格。准确的液体处理对于其一致性和可重复性而言至关重要，尤其是采用基于磁珠的尺寸筛选方法来获得目标大小的DNA片段时更是如此。
NGS文库构建通常包含3个主要步骤：
- 片段化：利用物理方法（如超声波破碎）或酶切法（如非特异性内切酶）使DNA片段化，形成更小的可控片段以便进行测序。
- NGS文库生成：基于不同的NGS平台连接特定的接头，用于多重测序的索引（条形码）可在PCR过程中完成整合。
- 片段尺寸筛选/纯化：PCR生成的文库需要进行纯化以去除多余组分，如引物、引物二聚体、盐类以及聚合酶等，从而获得纯净的可测序样品。片段尺寸筛选也可用于分离目标DNA片段大小以进行测序。
自动化系统可提升准确度，尽可能地减少人为错误并提高测序数据的精确度和可靠性，同时大幅简化工作流程。
我们的解决方案：MIRO CANVAS是一款基于微流控技术的全自动NGS文库构建平台，一次运行即可完成酶切片段化、PCR步骤和磁珠纯化。
浏览我们的应用纪要，了解如何使用MIRO CANVAS来自动执行NGS文库构建流程。
或者，您也可以使用MAG或HEATMAG模块与ASSIST PLUS、VIAFLO 96或VIAFLO 384台式液体处理平台的组合来完成磁珠法工作流程。
步骤3：质量控制：定量、均一化和样品汇集
质量控制可保证文库的正确制备，减少错误，提高数据准确度并实现稳定可靠的测序结果输出。其可分为三个步骤：
- 定量：测定文库中的DNA浓度，以确保向测序仪中加载的物料量正确无误。
- 均一化：将样品浓度调节至均一水平，确保测序过程中每个样品的代表性相同。
- 样品汇集：等量混合均一化后的样品，以确保代表性平衡，同时尽可能地提高测序效率和通量。
我们的解决方案：定量、均一化和汇集过程中的移液步骤可以借助ASSIST PLUS移液工作站和D-ONE模块的组合来实现自动化。这种解决方案可以轻松应对复杂的液体处理任务，既省心又省力，配合专用的软件命令，工作列表的生成和移液步骤的执行都将变得轻而易举。
步骤4：测序
NGS可以通过多种技术来实现，比如来自Illumina、Oxford Nanopore和PacBio等公司的测序平台。浏览我们关于DNA测序方法的博文，了解不同技术的工作原理。您也可以查看我们的Sanger测序 vs NGS博文，详细了解他们的优势和劣势。