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技术人员的好伙伴 – 破解犬类表观基因组，推进肿瘤学发展
加快犬类癌症研究
隶属于兽医学院的Cho实验室正在研究出现在家养犬中的自然发生肿瘤，该研究是其转化研究的一部分，目的是增进我们对动物和人类癌症发病机制的理解。巨量的NGS数据改变了人类癌症研究，但兽医学领域却缺乏这样的积累。为了尝试像前者一样扩充犬类NGS数据库的数量，这所韩国的实验室发布了首个家养犬的表观基因组图谱1。目前，他们正在利用该数据借助类器官技术来研究癌症生物学，使有意义的观察结果成为比较医学策略的一部分。
Cho实验室的研究人员正在使用VACUSAFE安全吸液系统和VACUSIP便携式吸液系统来执行细胞培养管理、样品提取和NGS文库制备中的各个步骤。实验室设施主管Borris D.Aldonza解释说：“我们的核心兴趣是研究非人类哺乳动物体内自然发生的癌症的生物学发展过程，我们在兽医学院的地位使我们能够获得许多不同的样本。我们的日常任务之一就是微量吸取，设计紧凑的VACUSAFE和VACUSIP系统可实现精细控制的吸取技术，提供支持我们NGS工作所需的准确性，包括我们成功发表的首个家养犬参考表观基因组。”
用于高效准确类器官维持的吸液系统
Cho实验室正在使用类器官培养物来研究犬的表观基因组在癌症进展过程中是如何变化的。Borris继续说道：“我们正在用患癌犬模型来制造类器官，以填补这缺失的一环（原始数据），从而实现更加可靠的围绕犬类的治疗决策，并获得更有意义的观察结果以用于与人类类器官的比较。在我们的类器官研究中，我们所有的台式细胞培养仪器（包括真空抽吸系统）都会被用到，涉及到细胞培养、培养维持以及基本采样的相关活动。此前我曾使用过INTEGRA的真空吸液系统，在选择最初的设备来组建我们的设施时，我知道我们的细胞培养区需要它们。”
“我们以前的吸液系统使用脚踏板来控制吸取，这导致我们会经常无意中将类器官连同废液一起吸走。相比之下，VACUSAFE上的VACUBOY真空手持操作器采用了手指激活的阀门，能够精确地调节真空流量，从而实现灵敏的指尖控制。VACUSAFE还提供了多个真空强度设置，使我们能够控制吸力的大小，这非常适合柔和地处理像我们的类器官这样珍贵的样品。由于我们可以很好地控制吸液速度，微量吸取的准确性得以显著提升。VACUSIP是日常微量吸取任务的理想选择，因为它让我们能够从样品中吸出任何残留的液体，这是手动移液根本无法实现的。同时，它也为我们的基于微孔板和PCR板的样品吸液节省了大量的时间，”他补充道。
INTEGRA产品助力未来发展
“我们现在计划扩大实验室，以加强我们的细胞培养能力和类器官研究项目，我们预计会从INTEGRA购买更多的吸液系统来助力这一增长目标。此外，实验室还希望引入更精简的液体处理系统来帮助我们管理不断增加的工作量。MINI 96便携式电动移液器将是支持这一点的理想候选，特别是当我们将目标放在获取成千上万种小分子对犬类和人类类器官的丰富药物筛选数据上时。到目前为止，INTEGRA的产品已经帮助我们取得了很大的成就，我们计划使用这些稳健可靠的设备继续推动比较肿瘤学领域向前发展。”Borris总结道。
参考文献
- Son KH, Aldonza MBD, Nam AR, et al. Integrative mapping of the dog epigenome: reference annotation for comparative inter-tissue and cross-species studies. bioRxiv. Published online July 22, 2022:2022.07.22.501075. doi:10.1101/2022.07.22.501075