Accélérer la recherche sur les thérapies à ARN grâce au criblage à haut débit

Une approche fondée sur les données pour les thérapies à ARN

L’activité principale de TychoBio réside dans le criblage à haut débit d’oligonucléotides thérapeutiques. L’équipe étudie un large éventail de molécules, comme l’explique Mathurin Dorel, directeur scientifique : « Nous effectuons le criblage d’un grand nombre d’oligonucléotides : certains constituent des candidats-médicaments, tandis que d’autres sont simplement destinés à fournir des informations sur la régulation de l’ARN. L’objectif est de mettre au point un modèle permettant de comprendre la régulation de l’ARN et de nous aider à concevoir des thérapies à ARN plus efficaces, plus sûres et de meilleure qualité. » 

Les thérapies à ARN constituent un domaine de pointe pour le développement de médicaments, car elles permettent d’intervenir plus en amont dans le processus biologique que la plupart des approches conventionnelles basées sur de petites molécules ou des produits biologiques, qui ciblent les protéines. « Cette approche présente plusieurs avantages », explique Mathurin. Elle présente tous les avantages des petites molécules, comme la réversibilité, mais il est plus facile de concevoir une séquence adaptée à une cible spécifique, et elle peut également produire des effets bénéfiques plus durables. » Malgré les perspectives offertes par les thérapies à ARN, des recherches supplémentaires sur la biologie fondamentale de l’ARN, sa toxicité et son efficacité restent nécessaires. « Tout réside dans les détails. C’est pourquoi nous utilisons une approche à haut débit fondée sur l’apprentissage automatique. La séquence d’une molécule d’ARN ne fait pas tout : elle se replie à l’intérieur de la cellule et interagit avec divers éléments. Nous devons comprendre ce qui se passe lors de ces interactions afin d’anticiper d’éventuels effets toxiques et de garantir la sécurité des candidats-médicaments. »

Éliminer les goulots d’étranglement lors de la culture cellulaire

Les tests à haut débit nécessitent de consacrer un temps considérable à des tâches de routine liées à la culture cellulaire. « Nous utilisons le système d’aspiration sécurisé VACUSAFE d’INTEGRA pour accélérer les opérations de routine, notamment le retrait des milieux de culture et le lavage des cellules. Même si ces processus semblent anodins à première vue, ils peuvent s’avérer très chronophages lorsqu’on travaille sur des projets à haut débit. Lorsque nous travaillons avec cinq ou six plaques à la fois, le VACUSAFE est un moyen très pratique d’aspirer rapidement tous les liquides d’une plaque à 96 puits. Sans cet outil, nous devrions effectuer cette tâche manuellement à l’aide d’une pipette multicanal ; le VACUSAFE nous fait donc probablement gagner au moins 30 minutes par jour à chacun. Cela nous laisse davantage de temps pour générer les énormes ensembles de données nécessaires à nos algorithmes d’apprentissage automatique. »

De la flexibilité pour chaque application

L’équipe apprécie également la polyvalence du VACUSAFE, qui est proposé avec divers accessoires. « Ce produit est très simple à utiliser : il suffit de le brancher pour qu’il fonctionne. Lorsque nous travaillons avec des flacons, nous utilisons l’adaptateur VACUBOY à 1 canal, et pour les plaques, nous utilisons l’adaptateur à 8 canaux. Ces adaptateurs sont très faciles à installer et à retirer, faciles à nettoyer et parfaits pour nos expériences à haut débit. »

Le VACUSAFE est généralement conservé dans la hotte à flux laminaire utilisée pour les travaux de culture cellulaire chez TychoBio, mais grâce à sa portabilité, l’équipe peut le déplacer facilement dans le laboratoire, notamment d’une paillasse à l’autre, si nécessaire. « Nous devons souvent retirer des milieux de culture de plaques à 96 puits à différents endroits du laboratoire ; ainsi, plutôt que d’acheter un appareil pour chaque zone, nous déplaçons simplement le VACUSAFE là où nous en avons besoin. »

Un partenariat de confiance avec INTEGRA

La collaboration entre TychoBio et INTEGRA ne se limite pas au VACUSAFE : l’équipe a en effet opté pour toute une gamme de produits INTEGRA pour ses activités de laboratoire, notamment la pipette hybride SWITCH et les réservoirs INTEGRA. « J’ai travaillé avec les produits INTEGRA tout au long de ma carrière, c’est pourquoi ils se sont imposés comme un choix évident ici, chez TychoBio », déclare Mathurin. « La SWITCH associe le pipetage manuel et un mode de distribution répétée au sein d’un même appareil. Le fait de ne pas avoir à passer d’un distributeur à une pipette classique lorsqu’on utilise la SWITCH est vraiment pratique, et les réservoirs d’INTEGRA sont excellents car ils présentent des volumes morts très faibles, ce qui permet de limiter les pertes de liquide. »

Ce partenariat ne cesse de se renforcer à mesure que TychoBio développe ses activités de laboratoire. La qualité du service fourni par le représentant local d’INTEGRA revêt également une importance cruciale pour l’équipe, car elle lui permet de déterminer comment de nouveaux appareils pourraient s’intégrer à ses processus de travail. « Notre représentant nous a récemment présenté quelques nouveaux produits et nous avons commandé les deux tiers d’entre eux ! Nous avons vraiment hâte de tous les tester », conclut Mathurin.

Le VACUSAFE constitue une alternative sûre et facile à utiliser aux systèmes d’aspiration classiques. Découvrez comment ce système d’aspiration unique en son genre peut vous aider à optimiser les opérations de votre laboratoire.