· ユーザー証言
ハイスループットスクリーニングによるRNA治療薬研究の加速
RNA治療薬へのデータ駆動型アプローチ
TychoBioの研究の中核は、オリゴヌクレオチド治療薬のハイスループットスクリーニングです。同チームは非常に幅広い分子を対象としており、最高科学責任者のマチュラン・ドレルは次のように説明しています。「私たちは多くのオリゴヌクレオチドをスクリーニングしています。治療薬候補もあれば、単にRNAがどのように制御されているかに関する情報を得るために設計されたものもあります。」「目標は、RNA制御を理解し、より優れ、より安全で、より効果的なRNA治療薬の設計に役立つモデルを構築することです」
RNA治療薬は、タンパク質を標的とする大半の従来の低分子アプローチやバイオ医薬品アプローチよりも、生物学的プロセスのより早い段階で介入できるため、創薬における重要なフロンティアです。「このアプローチにはいくつかの利点があります」とDorel氏は説明しました。「低分子の持つ可逆性などの利点をすべて備えている一方で、特定の標的に対する配列設計がより容易であり、より持続的な効果をもたらす可能性があります」RNA治療薬の可能性にもかかわらず、基本的なRNA生物学、毒性、および有効性に関するさらなる研究が依然として必要とされています。「細部にこそ悪魔が宿るものであり、だからこそ私たちはハイスループットな機械学習ベースのアプローチを採用しているのです。RNA分子の配列がすべてではありません。細胞内で折りたたまれ、さまざまなものと相互作用します。起こりうる毒性を予測し、治療薬候補の安全性を確保するためには、これらの相互作用中に何が起こるかを解明する必要があります」
細胞培養中のボトルネックの解消
ハイスループットアッセイを行うということは、同社が基本的な細胞培養タスクの実施にかなりの時間を費やしていることを意味します。「私たちは、培地の除去や細胞の洗浄などのルーチンプロセスをスピードアップするために、INTEGRAのVACUSAFEコンパクトバキュームシステムを使用しています。これらのプロセスは一見些細なことに思えるかもしれませんが、ハイスループットプロジェクトに取り組む際には非常に時間がかかる場合があります。一度に5、6枚のプレートを扱う場合、VACUSAFEは96ウェルプレートからすべての液体を迅速に除去するのに極めて便利な方法です。これがなければ、マルチチャンネルピペットを使って手作業でその作業を行うことになるため、おそらく私たち一人あたり毎日少なくとも30分は節約できているはずです。これにより、機械学習アルゴリズムに必要な膨大なデータセットを生成するための時間をより多く確保できます」
あらゆるワークフローに対応する柔軟性
また、同チームは、多様なアクセサリーが用意されているVACUSAFEの柔軟性も高く評価しています。「製品全体が非常に扱いやすく、プラグを差し込むだけで、すぐに動作します。」フラスコを使用する場合はVACUBOY 1チャンネルアダプターを使用し、プレートを処理する場合は8チャンネルアダプターを使用します。「これらのアダプターは着脱が非常に簡単で、洗浄も容易であり、私たちのハイスループット実験に最適です」
VACUSAFEは通常、TychoBioでの細胞培養作業用にクリーンベンチ内に設置されていますが、ポータビリティに優れているため、必要に応じてチームは異なるラボ実験室エリアや実験台の間でユニットを移動させることができます。「実験室内のさまざまなエリアで96ウェルプレートから培地を除去しなければならないことがよくあるため、別の装置を購入するのではなく、必要に応じてVACUSAFEを移動させて使用しています」
INTEGRAとの信頼できるパートナーシップ
TychoBioとINTEGRAのパートナーシップはVACUSAFEにとどまらず、同チームはSWITCHハイブリッドピペットやINTEGRA試薬リザーバーなど、実験室全体でさまざまなINTEGRA製品を採用しています。「私はこれまでのキャリアを通じてINTEGRA製品を使用してきました。そのため、ここTychoBioでも自然な選択肢となりました」とマチュランは語りました。「SWITCHは、手動ピペットと連続分注モードの両方が1台のデバイスに統合されています。SWITCHを使用する際に、電動ピペットと通常のピペットを持ち替える必要がないのは本当に便利ですし、INTEGRAの試薬リザーバーはデッドボリュームが非常に少なく、液体のロスがほとんど出ないため素晴らしいです。」
TychoBioが実験室の能力を拡張する中で、パートナーシップは成長を続けており、地元のINTEGRA担当者による優れたサービスはチームにとって極めて重要であり、新しい機器が自らのワークフローにどのように適合するかを検討することを可能にしています。「最近、担当者の方がいくつかの新製品のデモンストレーションを行ってくれたのですが、紹介された製品の3分の2を注文してしまいました！すべての新製品を試すことを本当に楽しみにしています」とマチュランは締めくくりました。
