Neue Erkenntnisse über Protein-DNA-Interaktionen dank effizienterer Nukleinsäure-Extraktion

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Neue Erkenntnisse über Protein-DNA-Interaktionen dank effizienterer Nukleinsäure-Extraktion

Ein Team aus Forschenden des Fachbereichs Biologie an der Universität von Ostrava verwendet eine VOYAGER-12-Kanal-Pipette mit einstellbarem Spitzenabstand und einem Volumen von 50 Mikroliter sowie GripTip-Pipettenspitzen im ECO-Rack von INTEGRA Biosciences, um DNA, RNA und Proteine aus rekombinanten Bakterien und Pflanzen zu isolieren - vorwiegend aus Acker-Schmalwand (Arabidopsis thaliana) und Gerste (Hordeum vulgare). Die Gruppe untersucht anschließend die nichtkanonischen Strukturen der extrahierten Nukleinsäuren – beispielsweise viersträngige G-Quadruplexe, linksgängige DNA (Z-DNA) und kreuzförmige DNA – und die Interaktionen dieser ungewöhnlichen Formationen mit Proteinen, um dadurch wertvolle Erkenntnisse über die Entstehung zahlreicher schwerwiegender Erkrankungen zu gewinnen.

Erhebliche Zeitersparnis

Dr. Martin Bartas gehört zu den Forschenden, die sich mit diesem Vorhaben befasst haben, und beschreibt, wie das Team von den Möglichkeiten der INTEGRA-Pipetten profitiert: „Wir verwenden die elektronische 12-Kanal-Pipette VOYAGER für die manuelle DNA- und Proteinextraktion von bis zu 100 biologischen Proben pro Tag. Dank des automatisch einstellbaren Spitzenabstands können wir skalierbare Transfers zwischen qPCR- oder Mikrotitrationsplatten mit 96 Wells und 1,5 ml-Mikroröhrchen einfach und schnell durchführen. Wir verwenden die Pipette auch, um qPCR-Platten schnell mit Mastermix-Präparaten zu füllen, was den gesamten Extraktionsprozess beschleunigt.“

Die VOYAGER-Pipette ermöglicht dem Team, rasch Proben zwischen verschiedenen Laborgefäßen, z.B. zwischen Platten, Röhrchen, Trays und Fläschchen zu transferieren, was bisher eine große Herausforderung war. Auch können die Forschenden den Abstand zwischen den Spitzen schnell anpassen und eine einzelne qPCR-Platte mit 96 Wells in weniger als 15 Minuten pipettieren – im Gegensatz zu fast einer Stunde zuvor. Dr. Bartas fährt fort: „Die VOYAGER-Pipette mit einstellbarem Spitzenabstand ermöglicht uns, deutlich mehr qPCR-Platten pro Stunde zu pipettieren, wodurch wir viel Zeit sparen. Auch sind die Abweichungen zwischen den technischen Replikaten geringer, als dies mit bisherigen Pipettierungsmöglichkeiten der Fall war. Dadurch gewinnen wir an mehr Sicherheit und wissen, dass unsere Ergebnisse äußerst genau und zuverlässig sind.“

Dr Martin Bartas uses an INTEGRA VOYAGER multichannel pipette to perform DNA and protein extractions.
Foto mit freundlicher Genehmigung von Martin Bartas

Benutzerfreundlichkeit ist das A und O

Seit der Einführung von VOYAGER-Pipetten haben sich die Arbeitsabläufe im Labor für Dr. Bartas und seine Kolleginnen und Kollegen deutlich verbessert. Die Extraktion und Isolierung verlaufen deutlich reibungsloser und schneller. „Eines der frustrierendsten Probleme, mit denen wir im Labor konfrontiert sind, ist, dass sich Pipettenspitzen lösen und abfallen. Dank der INTEGRA-GRIPTIPS müssen wir uns mit diesem Problem nicht mehr auseinandersetzen, was eine große Hilfe bei der Beschleunigung unserer täglichen Arbeitsabläufe ist.“

„Die Bedienung der VOYAGER-Pipette ist ergonomisch und intuitiv. Außerdem ist sie sehr hochwertig gefertigt. Die Bildschirmanzeige ist scharf, leicht ablesbar und bietet viele nützliche Einstellungsoptionen für verschiedene Pipettieranwendungen, wie Verdünnungen, Rückpipettierung, Mehrfachaspiration und Verdünnungsreihen. Die INTEGRA-Pipetten und GRIPTIPS sind rasch meine erste Wahl geworden, darum kann ich diese benutzerfreundlichen Produkte nur weiterempfehlen,“ so Dr. Bartas abschließend.