Unterstützung von HIV-Studien durch reduzierte Gel-Ladezeiten

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Unterstützung von HIV-Studien durch reduzierte Gel-Ladezeiten

Scarlette Abbou, Ingenieurin am CNRS, beschreibt die Arbeit in ihrem Labor wie folgt: „Als Reservoire für HIV agieren unter anderem CD4 T-Zellen, die im frühesten Stadium der Infektion gebildet werden. Diese latenten Reservoire sind in der Lage, die antiretrovirale Therapie (ART) zu überleben. Dies ermöglicht infizierten Zellen, reaktiviert zu werden und HIV zu produzieren, nachdem die Behandlung abgebrochen wurde oder wenn sich eine Resistenz entwickelt. Unser Team untersucht alle Faktoren, die zum Überleben des Virus unter diesen Umständen beitragen, was für das Voranbringen neuer Therapien sehr wichtig ist.“

Unterstützung von HIV-Längsstudien

Das Labor arbeitet mit einer Kohorte von HIV-positiven Patienten, die seit den 1990er Jahren beobachtet werden. Es überwacht ihre Therapien und das Fortschreiten der Erkrankung. Die VOYAGER-Pipette mit einstellbarem Spitzenabstand ist zum wesentlichen Bestandteil dieser Arbeit geworden, denn sie unterstützt umfassende Screenings zahlreicher Patientenproben, die analysiert werden müssen. Scarlette weiter: „Einer der Aspekte, die wir untersuchen, ist die Anlage und die Dynamik des HIV-Reservoirs durch die Untersuchung von Resistenzmutationen. Wir erhalten die Blutproben vom Patienten und extrahieren sowohl die CD4 T-Zellen als auch die genomische DNA vom Wirt. Wir führen eine PCR mit dem Provirus durch – das Virusgenom, das in die DNA einer Wirtszelle integriert wird – und analysieren dann die PCR-Produkte auf einem Gel, um die Grösse der Fragmente zu erkennen und ob sie verkürzt oder vollständig sind (ca. 10 kb Länge). Nach der Gel-Elektrophorese nehmen wir eine Aufreinigung der PCR-Produkte und Sequenzierung vor.“

Gaël Petitjean, Research Engineer; Scarlette Abbou, Engineer; and Suzie Houssier, Post-Doctoral Researcher at the Centre National de la Recherche Scientifique in Montpellier.
Photo Courtesy of CNRS - Gaël Petitjean, Research Engineer; Scarlette Abbou, Engineer; und Suzie Houssier, Post-Doctoral Researcher am Centre National de la Recherche Scientifique in Montpellier

Sorgfältige Abarbeitung grosser Probenanzahl

Unsere Kohorte besteht aus rund einem Dutzend Patienten. Das Screening zahlreicher Proben für jeden einzelnen ist viel Arbeit. Oft sortieren wir am Ende etwa eine Million Zellen aus einer Blutprobe. Um sicher zu sein, dass wir ein individuelles Provirus amplifizieren, führen wir eine PCR mit limitierender Probenverdünnung – oder digitale PCR – durch, was bedeutet, dass wir für jeden Patienten bis zu 20 PCR-Platten auf einmal vorbereiten. Wenn wir diese Proben auf ein Gel laden, müssen wir von der 96-Well-Platte auf das Gel pipettieren. Mit einer Mehrkanalpipette mit festem Abstand könnten wir nicht mehrere Proben gleichzeitig transferieren, da die Wells im Gel enger beieinander sind als auf der Platte. So mussten wir ursprünglich alle dieser Proben manuell eine nach der anderen pipettieren. Das kostete viel Zeit, zumal es wichtig ist sorgfältig vorzugehen, um nicht das Gel zu zerreissen.“

„Die grosse Menge an Zeit, die benötigt wurde, um grosse Probenmengen zu bearbeiten, war ein grosses Problem. Wir kontaktierten verschiedene Unternehmen, um herauszufinden, ob sie elektronische Pipetten mit automatisch einstellbarem Spitzenabstand anbieten – und so haben wir INTEGRA gefunden! Ein Vertreter des Unternehmens hat uns besucht und verschiedene Pipetten zum Ausprobieren mitgebracht. Die VOYAGER hat mir gleich gefallen; sie liess sich wirklich einfach anwenden und mit verschiedenen Programmen steuern. Wir haben vor einigen Jahren zwei 8-Kanal-VOYAGER gekauft und waren sofort froh darüber, wie sie unseren Arbeitsablauf verbessert haben! Die VOYAGER verringert die Zeit für einen Probentransfer von einer 96-Well-Platte auf eine Gelplatte von ca. 40 Minuten auf 5 Minuten oder weniger. Das ist fantastisch, wenn Sie zahlreiche Platten für verschiedene Patienten abarbeiten müssen! Ich habe ausserdem eine erhebliche Verbesserung der Genauigkeit bemerkt, da ich nicht jeden Well einzelnen pipettieren musste. So verliere ich nicht den Punkt, an dem ich mich gerade befinde, und mache keine Fehler. Pipetten mit zwei verschiedenen Volumengrössen zu haben – 50 und 125 µl – gibt uns ausserdem eine höhere Flexibilität für verschiedene Tests.”

VOYAGER Tip Spacing Pipette
VOYAGER-Pipette mit einstellbarem Spitzenabstand

Höhere Flexibilität für unterschiedliche Arbeitsabläufe

„Die VOYAGER hat für das Labor einen erheblichen Unterschied gemacht; viele Kollegen haben jetzt gesehen, wie sie von dieser Pipette profitieren können und haben sie für die eigenen Versuche genutzt. Einer meiner Kollegen führt zum Beispiel qPCR mit 384-Well-Platten durch und hat mit dem Pipettieren zwischen den kleinen Wells dieser Platte und anderen Plattenformaten gekämpft. Jetzt müssen wir uns für die Benutzung abwechseln! Aber es ist erstaunlich, denn es spart wirklich allen Zeit und macht uns frei für andere Versuche. Das Bearbeiten von Proben geht jetzt so viel schneller, so dass ich viel mehr Zeit habe, meine Ergebnisse auszuwerten oder mit der Vorbereitung meiner nächsten Gelplatte oder einer nächsten PCR-Runde zu beginnen.

Zusätzliche Merkmale und hervorragende Ergonomie

„Es gefällt mir sehr, wie auf die Pipette die GripTips von INTEGRA aufgesetzt werden –  es ist unglaublich einfach. Mit nur einem einfachen Handgriff haben Sie das Gefühl, dass die Spitzen wirklich sicher befestigt sind und Sie keine Probleme beim Aspirieren oder Dispensieren haben werden. Sie können sogar die Aspirationsgeschwindigkeit einstellen, um das Eindringen von Blasen zu vermeiden. Es ist beeindruckend, dass mehrere Spitzen auf diese Weise befestigt werden können und darauf vertraut werden kann, dass sie nicht tropfen oder mitten im Versuch abfallen. So gehen keine Proben verloren und es werden keine anderen Wells kontaminiert. Ich kann rasch alle acht Spitzen aufsetzen, den Abstand einstellen und mich in meine Experimente vertiefen. Sehr erfreulich ist auch, dass die Spitzen in Boxen zu 384 Stück geliefert werden. Wir sparen so Laborplatz, da die Box viele Spitzen enthält. Der geringere Plastikverbrauch schont die Umwelt. Die Mehrkanal-Reagenzreservoire sind in dieser Hinsicht auch grossartig, da sie zu jeweils 50 Reservoiren gestapelt werden und ineinander passen, um Platz zu sparen. Jedes Reservoir lässt sich leicht in einem wiederverwendbaren Trägergefäss platzieren.“

 

„Dank der VOYAGER bin ich in meiner Forschungsarbeit wesentlich schneller vom Test zum Ergebnis gekommen. Eine elektronische Mehrkanalpipette macht das Pipettieren derart grosser Probenzahlen wirklich einfach. Zudem ist die VOYAGER besonders komfortabel in der Anwendung und die Form gefällt mir auch sehr. Ausserdem ist das Geräusch, mit dem die Pipette das Ende des Programms signalisiert, ein wohlklingender Schlussakkord! Es gibt mir das Gefühl, dass die Arbeit gut gemacht ist – es ist perfekt.“