Rationalisation du criblage des modulateurs des transporteurs de solutés (SLC) grâce à des solutions de pipetage automatisées
Cibler les SLC pour lutter contre les maladies complexes
Solgate a été fondée en 2020 dans le but de changer le cours de la maladie en modulant les SLC – des protéines membranaires qui contrôlent l’absorption cellulaire et la distribution des nutriments clés, des métabolites, des molécules de signalisation et des ions. Georgi Dimchev, Senior Scientist chez Solgate, explique pourquoi cette famille de protéines méconnue est devenue une priorité de recherche : « Les SLC sont une famille de protéines importante et insuffisamment explorée qui a toujours été difficile à étudier. Jusqu’à récemment, il manquait, et il manque encore, les informations structurelles à haute résolution pour de nombreuses SLC et, dans de nombreux cas, nous ne connaissons toujours pas la fonction précise ou le substrat de certains transporteurs SLC. Cependant, elles sont essentielles au maintien de l’homéostasie cellulaire et leur dysfonctionnement est lié à un large éventail d’affections, notamment des troubles métaboliques, des maladies inflammatoires ou des affections neurologiques. Cela fait des SLC des cibles pharmacologiques très intéressantes. »
Les progrès de technologies telles que la cryo-microscopie électronique (cryo-EM) et la mise au point d’essais biologiques plus sophistiqués ont ouvert de nouvelles voies pour la découverte de médicaments ciblant les SLC. Solgate a développé une plateforme dédiée alliant chimie, biologie cellulaire et outils informatiques afin d’identifier les SLC pertinents pour la maladie et de concevoir des modulateurs puissants et sélectifs. L’équipe donne la priorité aux cibles ayant des liens génétiques étroits avec la maladie et vise à restaurer ou à corriger la fonction du transporteur grâce à des thérapies à base de petites molécules.
Des flux de travail automatisés pour prendre en charge des essais complexes
Le criblage à haut débit est au cœur de l’approche de la société en matière de découverte de médicaments. L’équipe effectue régulièrement des essais à contenu élevé basés sur la microscopie dans des plaques de 384 puits, traitant des centaines d’échantillons chaque semaine. Chaque flux de travail comporte une série d’étapes complexes, notamment l’ensemencement des cellules, le dosage des composés, l’incubation, la coloration et la fixation. L’automatisation est devenue essentielle pour que le laboratoire puisse gérer ce niveau de complexité à grande échelle. « Lorsque vous manipulez autant de plaques sur plusieurs projets, la reproductibilité devient une nécessité », explique Georgi Dimchev. « Non seulement le pipetage manuel ralentit les choses, mais il augmente aussi le risque de variabilité. Pour minimiser ce phénomène, nous automatisons autant d’étapes que possible. »
Améliorer la reproductibilité et la fiabilité
Le laboratoire utilise actuellement les robots de pipetage ASSIST PLUS et les pipettes électroniques VIAFLO pour automatiser les tâches standard dans plusieurs projets de recherche, améliorant ainsi la régularité entre les expériences. C’est indispensable dans un laboratoire où les essais clés sont répétés chaque semaine. « Nous effectuons souvent le même essai chaque semaine avec de nouveaux composés, en utilisant des contrôles standardisés afin normaliser les résultats », explique Georgi Dimchev. « Si le pipetage varie d’une série à l’autre, les contrôles ne se comportent pas de la même manière et l'essai n'est plus fiable. C’est pourquoi nous nous sommes concentrés sur l’automatisation à chaque fois que cela est possible ».
Les solutions d’automatisation d’INTEGRA garantissent une distribution cohérente des réactifs et éliminent les erreurs manuelles, tandis que les mouvements des pipettes, alignés et contrôlés avec précision, protègent les couches cellulaires délicates contre les perturbations. Ensemble, ces facteurs sont vitaux pour générer des données de haute qualité et reproductibles d’une expérience à l'autre.
Outils intuitifs de manipulation des liquides pour une équipe en pleine croissance
Malgré les nombreux avantages potentiels, l’automatisation des laboratoires n’est efficace que si elle est facile à comprendre et à mettre en œuvre pour les scientifiques. L’une des principales raisons pour lesquelles Solgate a choisi les solutions de pipetage d’INTEGRA était leur facilité d’utilisation, car la start-up avait besoin d’outils pouvant être rapidement adoptés par des scientifiques de tous niveaux d’expérience, sans avoir besoin d’une formation approfondie. Ivana Rinklake, Research Associate chez Solgate, déclare : « L’ASSIST PLUS et le VIAFLO sont vraiment accessibles. Tout le monde les utilise dans le laboratoire : des nouveaux employés aux scientifiques chevronnés. L’interface commune à toutes les pipettes INTEGRA facilite l’apprentissage de leur utilisation, qu’il s'agisse d’une tâche de base ou d’un protocole plus complexe à plusieurs étapes. »
Georgi Dimchev ajoute : « Le logiciel VIALAB est également très intuitif. Vous pouvez schématiser visuellement votre protocole, simuler la série et la charger directement sur ASSIST PLUS. Le passage d’un programme à l’autre ne nécessite que quelques clics, et il est même possible d’intégrer des pauses d’incubation et des messages pour l’utilisateur, afin que le système vous guide tout au long du processus avec un minimum d’intervention. »
Un service client et une assistance hors pair
Le service client d’INTEGRA a également joué un rôle clé dans le soutien du travail de Solgate. L’équipe reçoit des réponses rapides aux questions techniques, bénéficie d’une aide à la mise en place de nouveaux flux de travail et de délais rapides pour les réparations. Une assistance est toujours disponible en cas de besoin, ce qui s’avère essentiel dans un environnement de recherche qui évolue rapidement. Ivana Rinklake explique : « Que nous ayons besoin d’une formation, d’un dépannage ou d’une réparation, notre représentant local INTEGRA est toujours réactif et serviable. Contrairement à beaucoup d’autres sociétés d’équipement de laboratoire, où le support peut prendre des semaines, INTEGRA est rapide, flexible et proactive. »
Une solution évolutive pour la science de pointe
Les systèmes de pipetage d’INTEGRA ont fourni la base dont Solgate a besoin pour développer sa recherche à haut débit. Leur facilité d’utilisation et la fiabilité de leurs performances, ainsi que l’assistance réactive d’INTEGRA, ont aidé l’équipe à se concentrer sur ses objectifs scientifiques sans être ralentie par des limitations techniques. Ivana Rinklake conclut : « Les systèmes ASSIST PLUS et les pipettes VIAFLO sont exactement ce dont nous avons besoin. Que vous soyez une start-up ou un grand laboratoire, c’est le type d’outils qui permettent à la science d’avancer plus vite, et ils nous ont aidés à créer une plateforme de criblage robuste qui peut évoluer avec l’entreprise. »