Revolution bei der Vorbereitung von Bibliotheken mit automatisierter Liquid-Handling-Integration

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Revolution bei der Vorbereitung von Bibliotheken mit automatisierter Liquid-Handling-Integration

NGS hat die genetische Forschung transformiert und ermöglicht es Wissenschaftlern, große Mengen an genetischem Material schnell und kostengünstig zu analysieren. Da Labore jedoch immer mehr Proben verarbeiten wollen, kann die Bibliotheksvorbereitung zu einer Hemmnis im Sequenzierungs-Workflow werden. seqWell wurde 2014 mit dem Ziel gegründet, diese Herausforderung zu meistern und die Vorbereitung von NGS-Bibliotheken zu revolutionieren. Das Unternehmen bietet als Service die schnelle Sequenzierung von Plasmiden an und stellt außerdem Bibliotheksvorbereitungs-Kits für Kunden her, die selbst Genome sequenzieren. Ein herausragendes Merkmal der seqWell-Angebote sind die echten Multiplexing-Lösungen, mit denen Forschende aus Hunderten bis Tausenden von Proben schnell NGS-Bibliotheken präparieren können. John Palys, Senior Automation Engineer bei seqWell, erläuterte: „Wir haben unsere Transposon-vermittelten Reagenzien so abgestimmt, dass wir die DNA-Fragmentierung, Adapter-Ligation und Amplifikation in nur einem Schritt durchführen können. Darüber hinaus enthält jedes von uns hergestellte Kit eine integrierte Normalisierungsfunktion, was einen einfachen, reibungslosen NGS-Arbeitsablauf gewährleistet. Eine bahnbrechend schnelle und hocheffiziente Neuheit sind unsere ExpressPlex Bibliotheksvorbereitungs-Kits, die den Aufwand für eine Bibliotheksvorbereitung auf einen einzigen Workflow von nur 90 Minuten reduzieren. Das bedeutet, dass die Forschenden weniger Zeit mit manuellen Aufgaben verbringen müssen und sich mehr der Datenanalyse und der Interpretation der Ergebnisse widmen können.“

Die Produktionsforscher von seqWell sind ständig auf der Suche nach Automatisierungslösungen, mit denen sie die Herstellung von Kits und Reagenzien beschleunigen können. Um dies zu erreichen, kombinierte das Unternehmen einen WELLJET-Reagenziendispenser von INTEGRA mit einer Fluent® Automation Workstation von Tecan. Diese integrierte Lösung füllt und verschließt automatisch die Platten mit den ExpressPlex-Reagenzien und gewährleistet so einen reibungslosen Produktionsprozess mit hohem Durchsatz. 

John Palys fuhr fort: „Die Integration des WELLJET in den Tecan Liquid Handler war dank der einfachen Schnittstelle, der leichten Programmierung und der mühelosen Bedienung beider Instrumente sowie des umfassenden Kundensupports von INTEGRA problemlos möglich. Durch die Kombination der beiden Systeme konnten wir die Produktion unserer Bibliotheksvorbereitungs-Kits erheblich effektivieren, sodass wir nun in einer einzigen Charge bis zu 50 Platten füllen können. Wir können den WELLJET auch separat verwenden, um Platten zu befüllen, wenn der Tecan Liquid Handler bereits im Einsatz ist, und so unseren Arbeitsablauf frei nach unseren Bedürfnissen gestalten.“

Das seqWell-Team rechnet mit einer steigenden Kundennachfrage – und mehr Sequenzierungsaufträgen pro Tag –, da NGS sich zunehmend durchsetzt. „Unser Ziel ist es, die genetische Sequenzierung zu erleichtern und zu effektivieren, damit Wissenschaftler bahnbrechende Entdeckungen in den Biowissenschaften und der Medizin machen können. Hierzu nutzen Labore auf der ganzen Welt modernste Automatisierungslösungen – wie sie von INTEGRA und Tecan angeboten werden“, schloss John Palys.

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